По данным ЦГСЭН г. Бишкек на его контроле  находится 30 продовольственных рынков, из них 5 крупных («Ошский», «Аламидинский», «Орто–Сай», «Чынар», «Баят») и 25 мини-рынков.

Крупные рынки не в полной мере обеспечены специализированными павильонами по реализации молочной, рыбной, мясной продукции, в них не достаточно холодильного оборудования. Данная продукция продается без сопроводительных документов, что может привести к возникновению зооантропонозных заболеваний. Есть факты и зарегистрированы случаи заражения острыми кишечными инфекциями (бактериальная дизентерия, сальмонеллез, вирусный гепатит «А», бруцеллез, туберкулез, эхинококкоз).

Утвержденные ЦГСЭН планы мероприятий по улучшению санитарного состояния рынков не выполняется своевременно и в полном объеме. Несмотря на проводимые ежемесячные санитарные дни и санитарные часы, основная и прилегающие территории находятся в крайне неудовлетворительном состоянии.

Центром Госсанэпиднадзора г. Бишкек по выявленным нарушениям вынесено 93 постановления штрафом на сумму 120 000 сом, и вынесено 282 постановления о приостановлении эксплуатации действующих объектов.

По улучшению санитарно-технического состояния рынков подготовлено 144 санитарных предписания. За истекший период ликвидировано 512 стихийно организованных точек на рынках и прилегающих к ним территориям.

Учитывая сложившуюся санитарно-эпидемиологическую ситуацию на рынках города и наступление жаркого периода года, Центр Госсанэпиднадзора г. Бишкек призывает горожан при приобретении продуктов питания обращать внимание на условия, сроки хранения продуктов, наличие сопроводительных документов, кушать только в специализированных стационарных предприятиях общественного питания.